Les commentaires, établis à la suite de réunions académiques et nationales, sont destinés d'une part à aider le professeur dans sa démarche pédagogique, d'autre part à compléter et à interpréter le programme et les compétences attendues du baccalauréat STL Biochimie-génie biologique.
Certaines de ces compétences ne méritent pas de commentaires particuliers, mais beaucoup d'entre elles font l'objet d'une explicitation tant sur le plan de l'étendue et du niveau des connaissances enseignées que sur le plan de l' évaluation de ces connaissances.

Toutes les compétences attendues doivent être évaluées pendant la formation; néanmoins ce principe admet quelques exceptions qui sont précisées dans les commentaires. Mais toutes les compétences évaluées pendant la formation ne sont pas forcement évaluées à l'examen: ces compétences non évaluées à l'examen sont également précisées dans les commentaires.