Trois instruments sont dédiés à l'étude de la structure interne du Soleil :

Un volet important de la mission SOHO porte sur l'analyse des vibrations de la surface du Soleil pour en sonder les profondeurs.
La surface du Soleil oscille, se soulevanbt et s'abaissant, avec une amplitude qui peut atteindre des dizaines de kilomètres et des vitesses de quelques centaines de mètres par seconde. Ces oscillations proviennent d'ondes piégées à l'intérieur du Soleil. L'étude de ces ondes, l'héliosismologie, permet d'accéder aux conditions physiques (température, densité) et à la composition chimique interne au Soleil, tout comme les ondes sismiques révèlent la structure des couches terrestres qu'elles traversent.

Les instruments GOLF, VIRGO et MDI mesurent la vitesse des déplacements verticaux avec une précision supérieure à 1 mm.s ^-1 .